忽必烈曾兩征日本，兩次海上遠征均以失敗告終

高麗盡管已經由蒙古人駐守，但是，仍處於經常反叛的狀況。高麗朝廷已經撤退到與漢城遙遙相望的江華小島上，並在島上指揮抵抗。然而，1258年高宗〔王瞮〕遣世子王典作為人質到蒙哥宮廷。忽必烈繼任大汗後，送這位年輕的王子回國統治高麗，他還使他成為自己的女婿。從此，高麗王朝通過與元朝王室的這一聯姻成瞭一位順從的屬臣。

　　忽必烈還要求日本表示效忠。日本鐮倉幕府八代執權北條時宗1268年－1284年在位)兩次拒絕1268年和1271年)。忽必烈於1274年派出由150艘船隻組成的艦隊，載著遠征軍，向日本群島進發，軍隊在高麗東南海岸上船，夷平瞭對馬島和壹歧島，在下關附近九州島上的博多呂崎)灣登陸。但是草原騎兵們不習慣這些海上遠征。況且，他們的打算僅僅是由他們構成入侵軍的核心，軍隊的主體則是由特別厭戰的中國人和高麗人組成的輔助軍。無論如何，隱蔽在麥諸基要塞附近的九州的大名們奮力抵抗，結果在經歷瞭短時的退卻據說是受中國火炮逼迫)之後，他們迫使入侵者退回船上。

　　1276年，忽必烈重申要日本效忠的要求，再次遭到北條時宗的拒絕。忽必烈在長期備戰之後，於1281年6月派出更大的船隊進攻日本，一支由45，000蒙古人和120，000中國-高麗人組成的軍隊，他們分別在九州博多呂崎)灣及肥前省的鷹島和平盧登陸。但是，這一次，蒙古軍完全離開瞭他們的環境)和中國-高麗軍幾乎沒有軍事價值)還是未能抵擋住日本人的憤怒。尤其是1281年8月15日的一場可怕的颶風驅散或摧毀瞭蒙古艦隊，蒙古部隊失去瞭根基，或者被俘，或者被殺。